全基因組分析相關(guān)論文文獻(xiàn)

　　全基因組分析在農(nóng)作物、生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域應(yīng)用是比較廣泛的，農(nóng)作物、生物基因研究人員晉升職稱會(huì)發(fā)表相關(guān)的論文，為此學(xué)術(shù)顧問(wèn)在這里推薦了幾篇全基因組分析相關(guān)論文文獻(xiàn)，發(fā)表論文的人員可作為參考：

　　文獻(xiàn)一、滬農(nóng)靈芝1號(hào)全基因組分析和演化比較

　　摘要對(duì)"滬靈芝"(Ganoderma lucidum SH)等23個(gè)真菌物種進(jìn)行全基因組系統(tǒng)發(fā)生分析,進(jìn)一步選取其中具有代表性的物種進(jìn)行比較基因組學(xué)分析。全基因組系統(tǒng)發(fā)生分析和分子鐘估計(jì)結(jié)果顯示,滬靈芝分化時(shí)間(8.75百萬(wàn)年前)明顯晚于靈芝屬分化時(shí)間(180百萬(wàn)年前);基因家族尺寸和直系同源基因數(shù)目分析顯示,與另外參試靈芝菌種相比滬靈芝基因家族具有一定的收縮趨勢(shì);進(jìn)一步對(duì)基因家族數(shù)目進(jìn)行比較的結(jié)果顯示,滬靈芝逆轉(zhuǎn)錄酶家族發(fā)生了顯著擴(kuò)增。GO功能分析提示滬靈芝逆轉(zhuǎn)錄酶家族的功能富集主要為核酸結(jié)合功能和酶的催化活性。

　　出處《食用菌學(xué)報(bào)》 CSCD 北大核心 2016年第2期1-5,19,共6頁(yè)

　　關(guān)鍵詞靈芝 全基因組分析 分子鐘 基因擴(kuò)增 GO功能分析

　　文獻(xiàn)二、歐洲山楊bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族全基因組分析

　　摘要為了研究歐洲山楊中bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族成員的分類和進(jìn)化,分析其在干旱脅迫應(yīng)激中可能行使的功能,本研究利用多種生物信息學(xué)手段從全基因組水平鑒定和解析歐洲山楊bHLH轉(zhuǎn)錄因子,并對(duì)干旱脅迫下的歐洲山楊根部轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行分析.結(jié)果顯示,歐洲山楊的基因組中有167個(gè)bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族蛋白.通過(guò)與擬南芥bHLH蛋白序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析將其分為15個(gè)亞家族,并推測(cè)出39個(gè)PtbHLH的功能,這些功能表明bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族涉及到歐洲山楊生長(zhǎng)發(fā)育的多個(gè)生理過(guò)程.基因結(jié)構(gòu)和motif分析顯示,同一亞家族中幾乎所有的PtbHLH都有相似的外顯子/內(nèi)含子排布和蛋白質(zhì)motif結(jié)構(gòu).此外,利用RNA-seq數(shù)據(jù)分析干旱脅迫處理下PtbHLH基因的表達(dá)情況,篩選出4個(gè)潛在的bHLH抗旱蛋白.

　　關(guān)鍵詞歐洲山楊 BHLH 轉(zhuǎn)錄因子 全基因組分析

　　文獻(xiàn)三、貝萊斯芽孢桿菌Mr12預(yù)防蘋果輪紋病等病害的潛力及其全基因組分析

　　摘要【目的】探究新疆野蘋果內(nèi)生貝萊斯芽孢桿菌Mr12對(duì)多種植物病害的生防潛力,明確其抑菌活性物質(zhì)穩(wěn)定性、抑菌作用表現(xiàn)和抑菌物質(zhì)遺傳基礎(chǔ),為生防制劑開發(fā)利用提供依據(jù)。【方法】采用平板對(duì)峙法測(cè)定菌株Mr12對(duì)6種供試植物病原菌的抑制作用。以蘋果輪紋病菌(Botryosphaeria dothidea)為供試病原菌,測(cè)定Mr12無(wú)菌濾液抑菌穩(wěn)定性及無(wú)菌濾液對(duì)蘋果輪紋病菌孢子萌發(fā)和菌絲生長(zhǎng)的影響;利用3代測(cè)序平臺(tái)Nanopore測(cè)定Mr12的全基因序列,通過(guò)BLASTX比對(duì)注釋所含基因,預(yù)測(cè)分析菌株Mr12抑菌作用的遺傳基礎(chǔ)。【結(jié)果】菌株Mr12對(duì)6種供試植物病原菌均具有抑制作用,抑制率在55%~91%。該菌株無(wú)菌濾液在pH 4~10范圍內(nèi)抑菌活性穩(wěn)定,對(duì)酸堿的耐受范圍廣;對(duì)紫外線照射和蛋白酶K不敏感,80℃以內(nèi)具有較強(qiáng)的熱穩(wěn)定性。Mr12無(wú)菌濾液可使蘋果輪紋病菌菌絲膨大畸形,抑制菌絲生長(zhǎng)和孢子萌發(fā)。通過(guò)全基因序列信息分析,發(fā)現(xiàn)Mr12含有合成difficidin、fengycin、bacillibactin、surfactin等多種肽聚糖和聚酮糖類抗性化合物的基因簇,以及能夠降解病原菌細(xì)胞壁的β-1,3-葡聚糖酶和幾丁質(zhì)酶相關(guān)的基因。【結(jié)論】菌株Mr12對(duì)多種植物病原物具有廣譜拮抗作用,抑菌物質(zhì)穩(wěn)定性高,具有產(chǎn)生多種肽聚糖和聚酮糖類抗性化合物和細(xì)胞壁水解酶的能力。

　　關(guān)鍵詞蘋果 內(nèi)生細(xì)菌 抑菌廣譜性 貝萊斯芽孢桿菌 全基因組分析 抑菌穩(wěn)定性 抗菌機(jī)制

　　以上都是全基因組分析相關(guān)論文文獻(xiàn)，發(fā)表論文人員可作為參考，或者是您還想要了解這方面更多的文獻(xiàn)，以及期刊投稿方面的知識(shí)，可隨時(shí)和在線學(xué)術(shù)顧問(wèn)交流。

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