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    醫(yī)學(xué)論文晉級發(fā)表南海斑點馬鮫群體

    所屬分類:醫(yī)學(xué)論文 閱讀次 時間:2016-04-22 15:33

    本文摘要:發(fā)表學(xué)術(shù)論文網(wǎng) 辦的非常成功,極具口碑。在這里,你可以找到最具時事性的文章和最具代表性的各類文章。當然,因為免費和開源,大家都可以學(xué)習(xí)、借鑒和共同使用,如果你需要專屬于個人的原創(chuàng)文章,請點擊鏈接獲得專業(yè)文秘寫作服務(wù)。 摘 要: 本研究采用PCR技術(shù)

      發(fā)表學(xué)術(shù)論文網(wǎng)辦的非常成功,極具口碑。在這里,你可以找到最具時事性的文章和最具代表性的各類文章。當然,因為免費和開源,大家都可以學(xué)習(xí)、借鑒和共同使用,如果你需要專屬于個人的原創(chuàng)文章,請點擊鏈接獲得專業(yè)文秘寫作服務(wù)。

      摘 要: 本研究采用PCR技術(shù)對采自廣州附近海域的斑點馬鮫,19個個體的線粒體DNAD-loop基因進行擴增和分析,結(jié)果表明,該斑點馬鮫群體的遺傳多樣性較為豐富,19個個體通過聚類形成2大分支,表明該群體可能來源于2個不同的母系祖先。

      關(guān)鍵詞:遺傳多樣性; 斑點馬鮫; 線粒體DNA

      斑點馬鮫屬鯖科馬鮫屬,是暖水性魚類,是我國南海區(qū)重要的經(jīng)濟魚類。目前尚無關(guān)于斑點馬鮫群體遺傳多樣性的研究報道。線粒體DNA控制區(qū)是整個mtDNA序列和長度變異最大的區(qū)域,被廣泛應(yīng)用于魚類種群遺傳學(xué)研究。本研究利用相應(yīng)的引物對分布于南海的斑點馬鮫的控制區(qū)部分序列進行了PCR 擴增和序列測定,分析該斑點馬鮫群體的遺傳多樣性,以期為制定合理的斑點馬鮫資源增殖和保護措施提供科學(xué)依據(jù)。

      1 材料和方法

      1.1實驗材料 斑點馬鮫樣品于2007年6月取自廣州,冷凍或新鮮樣品運回實驗室,取背部肌肉保存于95.0%酒精中。

      1.2 實驗方法 按傳統(tǒng)法(酚/氯仿抽提法)從肌肉中提取基因組DNA,將提取DNA溶解于超純水中,置4ºC保存。用于擴增控制區(qū)的擴增引物為:DL-:5’-CTGGAAAGAACGCCCGGCATG-3’。PCR反應(yīng)體積為25 µL,其中包括50 mmol/L KCl,10 mmol/L Tris-HCl,pH8.3,MgCl2 1.5 mmol/L,dNTP 200 µmol/L,Ex Taq酶1.25 units,引物0.2 mmol/L,模板DNA 1µL,加滅菌蒸餾水至25 µL。PCR反應(yīng)在Eppendorf Mastercycler 5333擴增儀上進行。PCR反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性3 min,然后進行40個循環(huán),每個循環(huán)包括94℃45s,50℃45s,72℃ 1 min,最后72℃延伸10 min。以上反應(yīng)均用陰性對照來檢查是否有DNA污染。取1.5 µL擴增產(chǎn)物用1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測。用小量膠回收試劑盒(上海華舜生物工程有限公司)進行PCR產(chǎn)物回收和純化,回收產(chǎn)物由上海桑尼生物科技有限公司經(jīng)ABI公司3730 型全自動序列分析儀進行測序。

      1.3 數(shù)據(jù)分析 用DNASTAR軟件進行排序,并結(jié)合人工校正。通過MEGA(molecular evolutionary genetics analysis, Kumar 等,1993)軟件統(tǒng)計所測序列的堿基組成,并計算出不同個體間的遺傳距離,并構(gòu)建NJ系統(tǒng)樹。用DNASP(DNA Sequences Polymorphism)軟件進行單倍型多樣度(HD)、核苷酸多樣性(Pi)、平均核苷酸差異數(shù)(K)等遺傳多樣性參數(shù)的計算。

      2 結(jié)果

      2.1 目的片段的PCR擴增及序列測定 本實驗共測定了斑點馬鮫的19個個體的mtDNA D-loop基因片段,其堿基序列為514bp,A、T、C、G 4種堿基在19個個體中的平均含量分別為35.5%(35.2%-35.8%)、30.6%(30.1%-30.9%)、19.4%(19.1%-19.7%)、14.5%(14.2%-15.0%),AT含量(66.1%)高于GC含量(33.9%),其堿基的平均含量與藍點馬鮫比較相似。斑點馬鮫mtDNA-loop基因的AT含量(66.1%)與藍點馬鮫(68.2%)、太平洋鯖魚D-loop基因的AT含量(63.8%)非常接近,這也符合脊椎動物mtDNA D-loop區(qū)域堿基組成的特點。

      2.2 變異位點的分布 31個變異位點在19條斑點馬鮫D-1oop序列中的分布如表1所示,其中簡約信息位點為8個,它們分別位于第18、24、80、196、217、277、384、442位,其余的23個為單態(tài)信息位點。從表中還可以看出,19個個體的序列除2號和8號魚序列相同外,其他個體都不完全相同,即19個個體共有18種單倍型,單倍型多樣度為0.994,核苷酸多樣度為0.00798。514 bp長度的核苷酸序列中共存在3個堿基插入(24、180、494),20個轉(zhuǎn)換位點(A-G、C-T),5個顛換位點(位點8、34、282、488、491)及3個轉(zhuǎn)換與顛換同時存在的位點(位點197、198、483)。

      2.3 斑點馬鮫不同個體間的遺傳距離 應(yīng)用MEGA2軟件,根據(jù)D-loop序列算出了19個個體間的Kimura遺傳距離,19個個體中,除了SG2和SG8之間的遺傳距離為0.0000,其他任何2個個體間的遺傳距離均不為0.000,故共有18種單倍型;19個個體中SG.12與SG.14的遺傳距離遺傳距離最大為0.0179;19個個體間的堿基差異數(shù)在0~9之間。

      表1 變異位點在19條斑點馬鮫D-loop序列中的分布

      2.3 NJ系統(tǒng)樹的構(gòu)建 以19個個體的控制區(qū)序列構(gòu)建的NJ系統(tǒng)樹分別如圖1所示。從圖中可以看出,2種方法得到的系統(tǒng)樹的拓撲結(jié)構(gòu)相似,19個個體形成了2大分支。線粒體DNA屬于母系遺傳,可推斷該群體的19個個體可能來源于2個不同的母系祖先。

      圖1 由控制區(qū)序列得到的NJ系統(tǒng)樹

      3 討論

      在19個藍點馬鮫個體中檢測到18個單倍型,單倍型多樣度為0.994,核苷酸多樣度為0.00798。本研究從控制區(qū)序列獲得的群體遺傳多樣性參數(shù)和個體間的遺傳距離都表明了,斑點馬鮫南海水域群體目前的遺傳多樣性非常豐富。這種現(xiàn)象一方面與種類差異有關(guān);另一方面,可能與斑點馬鮫的棲息地多樣性、活動范圍大有關(guān)。因為斑點馬鮫有廣泛分布于南海水域的產(chǎn)卵場、索餌場和越冬場,并作長距離洄游。此外,斑點馬鮫不同于梭魚等其它增養(yǎng)殖魚類,尚未受到由于種苗培養(yǎng)而導(dǎo)致的近交等方面的影響,因而具有較豐富的遺傳多樣性。

      閱讀范文:醫(yī)學(xué)核心論文投稿住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)

      〔摘要〕目的:通過對北京地區(qū)普通專科醫(yī)師培訓(xùn)基地所在醫(yī)院,住院醫(yī)師培訓(xùn)實施現(xiàn)狀的調(diào)查,旨在找出影響住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)質(zhì)量的主要因素,提出改進住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)的對策,為完善住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)工作提供政策依據(jù)。方法:對北京地區(qū)普通專科醫(yī)師培訓(xùn)基地所在醫(yī)院的主管院長、基地負責(zé)人、主管教育部門管理人員、帶教老師、及住院醫(yī)師進行個人深入訪談,總結(jié)出影響住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)質(zhì)量的主要因素。結(jié)果:接受訪談的人員認為,由一名醫(yī)學(xué)院校畢業(yè)生轉(zhuǎn)變成為一名合格的醫(yī)生,必須要經(jīng)過系統(tǒng)的、規(guī)范的住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)。存在的主要問題為學(xué)員參加培訓(xùn)的積極性不高,基地?zé)o法為學(xué)員解決住宿,24 h住院醫(yī)師負責(zé)制無法實施,所在科室阻礙學(xué)員參加培訓(xùn),培訓(xùn)經(jīng)費不足,帶教老師水平和責(zé)任心直接影響培訓(xùn)效果。結(jié)論:住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)的實施過程尚未達到保障住院醫(yī)師培訓(xùn)目標的要求,培訓(xùn)質(zhì)量亟待提高。

      〔關(guān)鍵詞〕住院醫(yī)師培訓(xùn);實施現(xiàn)狀;對策;醫(yī)學(xué)教學(xué)

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